083200(097200) 食品科学与工程(一级学科硕士点) 本专业是以水产品、农产品和畜产品等生物资源为研究对象，依据食品的生物学、生化、营养、质构特性及其加工适性，应用食品科学理论与现代高新技术，重点开展食品的保鲜保藏、加工利用、品质评价、安全检测与控制等技术研究。我校开展(水产)食品加工的研究工作至今已有近百年的历史，本专业主要有以下几个研究方向。 1、食品安全与品质控制 (1)食品品质控制与提升技术 (2)高新技术在食品安全检测中的应用 (3)食品安全风险评估与预警 (4)食品生物技术 2、食品保藏及加工技术 (1)生鲜食品保鲜、水产品保活技术 (2)现代食品加工、制造与包装技术 (3)食品的冷藏链控制技术 3、食品营养与品质评价 (1)食品营养分析与功能评价 (2)食品色泽、风味、质构分析及其评价 4、海洋生物资源高值化利用 (1)水产食品精深加工与资源高值化利用 (2)海洋功能性食品与生物制品研发
080705制冷及低温工程 本专业主要从事制冷及低温工程领域的基础理论与工程应用研究，作为能源利用和国民经济发展的重要基础，制冷及低温工程广泛应用于建筑及生物贮藏、人工环境、石油化工、农业、医疗、交通运输及航天领域，尤其是在民用制冷、商业制冷、工业制冷、生物质冷冻冷藏技术等方面发挥了不可缺少的重要作用。 本专业的主要研究方向：食品冷冻冷藏工程，食品冷藏链集成技术、制冷装置仿真和优化，制冷装置的开发和测试。拥有一批国际先进的实验和测试仪器设备，在农业部冷库及制冷设备质量监督检验测试中心和学科实验研究中心的基础上，又建立了食品冷藏链研究中心及多个相配套的设备先进的实验室。 制冷及低温工程专业将动力机械与食品加工相结合，以食品冷冻冷藏研究为专业发展特色，在华东地区乃至全国的食品低温保藏领域发挥着重要的作用。
081704应用化学 上海海洋大学应用化学系于2003年获得硕士学位授予权。该硕士点综合了化学工程、环境工程、材料科学、生物化学、微生物学和食品工程等数个学科的交叉优势，形成了有别于上海相关高校同类学科的优势和特色；培养了具有复合型知识结构的高级技术人才，适合在企事业单位从事生产、教学、科研、技术管理及相关工作。 本专业的主要研究方向：食品应用化学，生物资源利用化学，食品分析及检测技术、天然产物化学及海洋生物制药。
071010生物化学与分子生物学 本硕士点专业综合了生物化学、分子生物学、微生物学和食品生物技术等数个学科领域交叉的优势。主要以海洋动植物、微生物等为研究对象，在蛋白质水平和分子基因水平上对海洋生物的功能性蛋白或活性多肽展开深入研究；另一方面，对食品安全中涉及到的各种有害微生物的作用机理展开研究。本专业的主要研究方向：鱼类肌肉分化和生长的机理研究、海洋生物功能性蛋白和多肽的基因工程制备技术、生物技术在食品安全评价和检测中的应用。
085231 食品工程 本专业主要是培养从事食品加工与保藏、食品生物技术、食品化学及应用、食品检测与分析、粮食与油脂加工、水产品加工、畜产品加工、果蔬加工、食品机械与包装、功能性食品、食品分离与重组等领域的应用研究和技术开发的高级工程技术与管理人才。
085206 动力工程 本专业是研究工程领域中实现物质、能量转换、传递和利用等过程及其装备的理论和技术，提高其利用率，并减少消耗和污染，推动国民经济可持续发展的应用技术学科，属于21世纪经济发展中的能源、信息、材料三大前沿领域之一。本学科既是一门完整而独立的学科，又与其它科学领域，如电子技术、计算机技术、材料科学和自动控制技术等相互渗透、交叉。因此，动力工程相关学科领域有热能工程、动力机械及工程、化工过程机械、液体机械与工程、机电一体化以及计算机应用等。本领域培养的工程硕士应成为从事动力工程领域科学研究与开发应用、工程规划与管理等方面的复合型高级工程技术人才。
095113 食品加工与安全 本专业以化学、生物学、微生物学、农业工程为基础，以各种生物材料尤其是水产品、农产品为主要对象，研究其贮藏、加工、检测、开发、食品卫生与安全的基本理论和应用技术，培养从事食品生产技术和质量管理、安全评价、分析检测、产品开发等领域的富有创新精神的高级专门人才。 083200食品科学与工程(一级学科博士点) 本学科前身为水产制造科，创建于1912年。在近百年的发展历程中，该学科在我国开创了罐头、饮料、冷冻食品的加工工艺研究，其中的水产品加工及贮藏工程学科1984年获硕士学位授予权，1998年被批准为农业部重点学科，2000年食品科学获硕士学位授予权，2003年水产品加工及贮藏工程获博士学位授予权，是目前上海唯一拥有的食品科学与工程学科一级学科博士点。2009年获食品科学与工程博士后科研流动站。经过多年的建设，本学科拥有一批世界先进的仪器设备，业已成为优势明显、师资力量雄厚、科研成果众多的学科，并培养本科生近万人、研究生700余人。 学科下设水产品加工及贮藏工程、食品低温物流工程、食品生物技术和食品科学4个研究方向。本学科秉承水产传统特色，重点在海洋生物资源开发与利用、食品物流与储运、食品安全与品质控制、食品生物技术等领域开展基础和应用研究，其中水产品加工领域在国际上有重要影响，在鱼糜及其制品加工、水产品保活保鲜、低温物流技术与装备等方面居国内领先地位。多年来本学科注重产学研合作，先后与光明食品（集团）有限公司合作，成立了“光明学院”和“现代食品产业发展研究中心”，与上海市食品研究所成立了“食品安全研究中心”，与上海伊禾农产品科技发展有限公司联合成立“蔬果保鲜技术研究所”。此外，本学科己拓展与美国、日本、英国等大学、研究机构的合作，扩大了本学科在国际学术界的影响，并促进与世界各地区的交流，提升学术综合实力。